23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0869 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0869  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  246  6e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1566  Protein of unknown function DUF555  78.07 
 
 
117 aa  185  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3353  Protein of unknown function DUF555  76.92 
 
 
117 aa  184  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.495659  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2742  Protein of unknown function DUF555  74.78 
 
 
123 aa  181  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2774  hypothetical protein  74.14 
 
 
124 aa  176  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2902  hypothetical protein  59.2 
 
 
129 aa  155  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.898547  hitchhiker  0.000859675 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0968  hypothetical protein  64.04 
 
 
114 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00181783  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0925  hypothetical protein  64.55 
 
 
114 aa  149  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0273  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000138863  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1084  hypothetical protein  55.36 
 
 
112 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000536212  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1165  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.068584  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0753  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0232818  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0819  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0068  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0078  hypothetical protein  56.36 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  0.432637 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0858  hypothetical protein  54.46 
 
 
112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1659  hypothetical protein  51.79 
 
 
112 aa  124  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.541388  normal  0.0564828 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0931  hypothetical protein  50.43 
 
 
119 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.863656  normal  0.159224 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1516  hypothetical protein  47.41 
 
 
152 aa  99  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2408  Protein of unknown function DUF555  44.44 
 
 
161 aa  96.7  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.696008  normal  0.514494 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0822  hypothetical protein  45.63 
 
 
169 aa  92.8  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0524  Protein of unknown function DUF555  46.85 
 
 
195 aa  87.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2443  Protein of unknown function DUF555  46.46 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>