14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0240 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0240  zinc finger protein  100 
 
 		 69 aa  143  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.665758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0148  zinc finger protein  72.46 
 
 		 71 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0852  hypothetical protein  66.18 
 
 		 69 aa  110  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1693  zinc finger protein  68.12 
 
 		 71 aa  107  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1138  zinc finger protein  63.77 
 
 		 69 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0785  zinc finger protein  65.22 
 
 		 71 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0207  zinc finger protein  66.67 
 
 		 71 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.423209  normal  0.336406 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1285  hypothetical protein  61.19 
 
 		 70 aa  98.6  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.378904 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1928  hypothetical protein  59.42 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2452  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0945683  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2453  zinc finger protein  49.23 
 
 		 73 aa  70.1  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.054676  normal  0.411172 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2373  hypothetical protein  51.11 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2374  hypothetical protein  37.5 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3681  hypothetical protein  36.76 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.10285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>