14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0852 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0852  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  142  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0240  zinc finger protein  66.18 
 
 
69 aa  110  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.665758  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1138  zinc finger protein  64.71 
 
 
69 aa  101  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1928  hypothetical protein  65.22 
 
 
69 aa  98.6  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0148  zinc finger protein  61.76 
 
 
71 aa  97.1  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1285  hypothetical protein  60.87 
 
 
70 aa  96.7  9e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.378904 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0785  zinc finger protein  60.29 
 
 
71 aa  94.4  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1693  zinc finger protein  60.29 
 
 
71 aa  94  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0207  zinc finger protein  58.82 
 
 
71 aa  92.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.423209  normal  0.336406 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2452  hypothetical protein  55.88 
 
 
76 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0945683  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2453  zinc finger protein  52.31 
 
 
73 aa  67.4  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.054676  normal  0.411172 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2373  hypothetical protein  41.1 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2374  hypothetical protein  40.62 
 
 
75 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3681  hypothetical protein  38.71 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.10285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>