43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3248 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3248  putative sulfur oxidation protein DsrF  100 
 
 		 115 aa  239  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000199759  hitchhiker  0.0000159534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2348  putative sulfur oxidation protein DsrF  30.91 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0587865  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2315  DsrE family protein  29.66 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000269455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2164  DsrE family protein  29.66 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000849847  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2207  DsrE family protein  36.25 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000232084  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1807  DsrE-like protein  35.9 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000142115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2199  sulfur relay protein TusC/DsrF  35.8 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000409085  normal  0.0885071 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2109  DsrE family protein  34.62 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000880697  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2003  DsrE family protein  35.8 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000582885  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1839  sulfur relay protein TusC  26.96 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000201161 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1924  DsrE-like protein  29.82 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.514773  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1780  hypothetical protein  25.42 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129474  normal  0.0463669 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2453  DsrE-like protein  37.18 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000033855  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2058  DsrE family protein  29.66 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0573181  hitchhiker  0.000337612 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1971  DsrE family protein  36.36 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000439065  normal  0.844283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2005  DsrE family protein  36.36 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0519969  hitchhiker  0.000302013 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2377  hypothetical protein  36.36 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2316  sulfur relay protein TusC/DsrF  25.69 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0137343  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3994  sulfur relay protein TusC  26.09 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0906893  hitchhiker  0.00530974 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28130  sulfur relay protein TusC  27.83 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3398  sulfur relay protein TusC  26.32 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.451628 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2016  DsrE family protein  28.81 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000118416  hitchhiker  0.00293118 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1520  DsrE family protein  32.05 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.435387  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3599  sulfur relay protein TusC  26.09 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1951  DsrF protein  23.08 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0170075  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1802  DsrE family protein  30.77 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.223353  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1656  DsrE family protein  23.73 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1954  DsrE family protein  24.58 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.414828  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0041  DsrF protein  22.68 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.630968  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0133  DsrE family protein  22.12 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000109278  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0700  sulfur relay protein TusC/DsrF  24.66 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.137823  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0034  sulfur relay protein TusC/DsrF  24.66 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1852  sulfur relay protein TusC/DsrF  26.03 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000304712  normal  0.0727441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2475  sulfur relay protein TusC/DsrF  33.77 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000087819  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2482  DsrF protein  21.82 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.067971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2134  DsrE family protein  32.47 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.0152295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2602  sulfur relay protein TusC  22.61 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.707769  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2378  sulfur relay protein TusC  24.35 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.643649  normal  0.0198653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30390  sulfur relay protein TusC  23.21 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4012  sulfur relay protein TusC  23.53 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0119239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3169  sulfur relay protein TusC  26.67 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.107229  normal  0.263841 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3339  DsrF family protein  25 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324949  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0308  intracellular sulfur oxidation protein DsrF  26.72 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00506784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>