38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2843 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2843  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  209  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00385808  hitchhiker  0.000128319 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1111  hypothetical protein  43.68 
 
 
93 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12110  hypothetical protein  42.53 
 
 
93 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08440  hypothetical protein  40.23 
 
 
92 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127353  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3793  hypothetical protein  40.23 
 
 
92 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2409  hypothetical protein  43.53 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3336  hypothetical protein  36.05 
 
 
90 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000115113  normal  0.014798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4677  hypothetical protein  38.04 
 
 
91 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4855  hypothetical protein  38.04 
 
 
91 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.5929  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4802  hypothetical protein  38.04 
 
 
91 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0619  hypothetical protein  38.04 
 
 
91 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823931  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4820  hypothetical protein  35.63 
 
 
91 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4360  hypothetical protein  36.36 
 
 
91 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734729  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1550  hypothetical protein  37.21 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0243  protein of unknown function DUF493  29.79 
 
 
94 aa  50.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4965  hypothetical protein  35.63 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2705  hypothetical protein  30.23 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2874  hypothetical protein  32.56 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000389579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2593  hypothetical protein  30.49 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00140819  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3025  hypothetical protein  32.93 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00091395  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1853  hypothetical protein  32.93 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000034763  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1197  hypothetical protein  34.15 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0107  hypothetical protein  26.83 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2953  hypothetical protein  32.93 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000897518  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0990  hypothetical protein  31.4 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000075069  normal  0.687839 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1051  hypothetical protein  31.4 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000671726  hitchhiker  0.00478592 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0986  hypothetical protein  31.4 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105204  normal  0.0165558 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1163  hypothetical protein  31.4 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0981  hypothetical protein  32.93 
 
 
89 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35106  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1515  hypothetical protein  26.83 
 
 
87 aa  41.2  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1468  hypothetical protein  26.83 
 
 
87 aa  41.2  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3322  hypothetical protein  29.27 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000559481  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3280  hypothetical protein  29.27 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000870695  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3458  hypothetical protein  29.27 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00375963  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1087  hypothetical protein  29.27 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000786654  hitchhiker  0.0000064685 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1265  protein of unknown function DUF493  26.83 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0383916  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0472  hypothetical protein  30.49 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439852  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0188  hypothetical protein  31.71 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0239865  normal  0.49594 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>