25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3441 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0116  hypothetical protein  100 
 
 
469 aa  968    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3441  hypothetical protein  100 
 
 
469 aa  968    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3219  hypothetical protein  100 
 
 
469 aa  968    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552064  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2836  hypothetical protein  100 
 
 
469 aa  968    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1595  hypothetical protein  100 
 
 
469 aa  968    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4868  transposase IS4 family protein  22.04 
 
 
450 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4159  transposase IS4 family protein  22.04 
 
 
450 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2751  transposase IS4 family protein  22.04 
 
 
450 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2134  transposase IS4 family protein  22.04 
 
 
450 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2032  transposase IS4 family protein  22.04 
 
 
450 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1951  transposase IS4 family protein  22.04 
 
 
450 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0782  transposase IS4 family protein  22.04 
 
 
450 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0692  transposase IS4 family protein  22.04 
 
 
450 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2712  hypothetical protein  23.25 
 
 
487 aa  45.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0225597  normal  0.016579 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3610  hypothetical protein  22.93 
 
 
487 aa  44.3  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1563  hypothetical protein  22.93 
 
 
487 aa  44.3  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.3587  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3609  hypothetical protein  22.93 
 
 
487 aa  44.3  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.156017  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0016  hypothetical protein  22.93 
 
 
487 aa  44.3  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0231  hypothetical protein  22.93 
 
 
487 aa  44.3  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1384  hypothetical protein  22.93 
 
 
487 aa  44.3  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2724  hypothetical protein  22.93 
 
 
487 aa  44.3  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000151584 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2373  hypothetical protein  22.93 
 
 
487 aa  44.3  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.653943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1527  hypothetical protein  22.93 
 
 
487 aa  44.3  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0837924  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2594  hypothetical protein  22.93 
 
 
487 aa  43.9  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0041999  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3229  transposase, IS4  20.23 
 
 
405 aa  43.1  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>