29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1372 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1372  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  613  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149261  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2867  transposase IS66  98.68 
 
 
450 aa  608  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.121515 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2795  transposase IS66  98.36 
 
 
532 aa  607  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1224  transposase IS66  99.27 
 
 
502 aa  556  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.321237  normal  0.0414458 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0875  transposase IS66  92.43 
 
 
532 aa  548  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019369  normal  0.0402909 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0442  transposase IS66  92.43 
 
 
532 aa  548  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.558302  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3392  transposase IS66  92.43 
 
 
532 aa  548  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1966  transposase IS66  92.43 
 
 
532 aa  548  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0592949  normal  0.381254 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1504  transposase IS66  92.43 
 
 
532 aa  548  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000423103  normal  0.013154 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1134  transposase IS66  92.43 
 
 
532 aa  547  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1376  transposase IS66  98.88 
 
 
502 aa  545  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154743  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1432  transposase IS66  25.59 
 
 
482 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0876  transposase IS66  24.52 
 
 
478 aa  45.8  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3447  transposase IS66  26.39 
 
 
482 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3186  transposase IS66  26.39 
 
 
482 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2952  transposase IS66  25.12 
 
 
482 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.102495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1457  transposase IS66  25.12 
 
 
482 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0220  transposase IS66  26.39 
 
 
482 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0193  transposase IS66  26.39 
 
 
482 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6835  hypothetical protein  29.7 
 
 
426 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6406  hypothetical protein  29.7 
 
 
426 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6173  hypothetical protein  29.7 
 
 
426 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2244  hypothetical protein  29.7 
 
 
426 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0633  hypothetical protein  29.7 
 
 
426 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8731  hypothetical protein  29.7 
 
 
426 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8271  hypothetical protein  29.7 
 
 
426 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8229  hypothetical protein  29.7 
 
 
426 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1295  transposase IS66  26.39 
 
 
482 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.364836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1806  transposase IS66  24.64 
 
 
482 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>