33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1202 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1202  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  699    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.337201  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0716  hypothetical protein  90.54 
 
 
349 aa  639    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.259332 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0107  hypothetical protein  89.97 
 
 
349 aa  639    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.421884  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0781  hypothetical protein  72.27 
 
 
361 aa  511  1e-144  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0951  hypothetical protein  59.89 
 
 
361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1579  hypothetical protein  31.88 
 
 
363 aa  63.5  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.224744  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1185  hypothetical protein  31.65 
 
 
379 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000205794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1207  hypothetical protein  31.65 
 
 
379 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000131866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1301  hypothetical protein  38.16 
 
 
415 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1035  protein of unknown function DUF795  34.38 
 
 
394 aa  57  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1353  protein of unknown function DUF795  25.78 
 
 
395 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000435416  normal  0.346041 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1734  hypothetical protein  24.18 
 
 
390 aa  54.7  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0912  hypothetical protein  34.83 
 
 
377 aa  53.9  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000411962  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1656  hypothetical protein  32.95 
 
 
369 aa  53.5  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.441829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0766  hypothetical protein  40.3 
 
 
416 aa  53.5  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.596783  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0716  hypothetical protein  37.5 
 
 
377 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000484275  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1979  hypothetical protein  35.29 
 
 
402 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1004  hypothetical protein  31.03 
 
 
401 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1231  protein of unknown function DUF795  25.97 
 
 
400 aa  50.8  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1697  hypothetical protein  35.29 
 
 
402 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1876  hypothetical protein  29.89 
 
 
406 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1231  hypothetical protein  29.17 
 
 
377 aa  50.8  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000420403  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1854  hypothetical protein  34.09 
 
 
425 aa  50.1  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.601235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1733  hypothetical protein  22.12 
 
 
401 aa  49.7  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.525076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1325  hypothetical protein  36.84 
 
 
417 aa  49.7  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0236  hypothetical protein  41.27 
 
 
389 aa  49.3  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.370523  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10190  predicted nucleotidyltransferase  36.36 
 
 
422 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0181602  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1279  hypothetical protein  38.46 
 
 
418 aa  46.6  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141845  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2713  protein of unknown function DUF795  32.67 
 
 
383 aa  46.2  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000229662  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1771  protein of unknown function DUF795  32.47 
 
 
416 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.251831  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1757  hypothetical protein  22.26 
 
 
425 aa  44.3  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2281  nucleotidyltransferase  30.3 
 
 
419 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00092029  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08168  Nitrogen metabolite repression regulator NmrA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59919]  24.73 
 
 
352 aa  42.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0063095  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>