49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1854 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1854  hypothetical protein  100 
 
 
425 aa  860    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.601235  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1757  hypothetical protein  56.67 
 
 
425 aa  496  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1279  hypothetical protein  53.86 
 
 
418 aa  444  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141845  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1407  hypothetical protein  51.78 
 
 
398 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0673785  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0047  hypothetical protein  46.26 
 
 
430 aa  377  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.367845  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10190  predicted nucleotidyltransferase  39.95 
 
 
422 aa  325  8.000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0181602  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1733  hypothetical protein  43.03 
 
 
401 aa  323  5e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.525076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1771  protein of unknown function DUF795  40.75 
 
 
416 aa  317  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.251831  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1301  hypothetical protein  39.58 
 
 
415 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1231  protein of unknown function DUF795  46.8 
 
 
400 aa  282  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1697  hypothetical protein  37.74 
 
 
402 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1979  hypothetical protein  37.26 
 
 
402 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0766  hypothetical protein  35.45 
 
 
416 aa  261  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.596783  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1325  hypothetical protein  38.31 
 
 
417 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1353  protein of unknown function DUF795  36.08 
 
 
395 aa  259  5.0000000000000005e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000435416  normal  0.346041 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1876  hypothetical protein  37.53 
 
 
406 aa  244  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1004  hypothetical protein  35.92 
 
 
401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2281  nucleotidyltransferase  30.37 
 
 
419 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00092029  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1734  hypothetical protein  36.96 
 
 
390 aa  211  3e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3684  hypothetical protein  35.93 
 
 
393 aa  209  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101034  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1231  hypothetical protein  35.14 
 
 
377 aa  206  5e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000420403  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4037  hypothetical protein  35.38 
 
 
393 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000110161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3752  hypothetical protein  35.5 
 
 
393 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000763516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3971  hypothetical protein  35.38 
 
 
393 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3667  hypothetical protein  35.38 
 
 
393 aa  204  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000869967  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1035  protein of unknown function DUF795  33.57 
 
 
394 aa  204  4e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3940  hypothetical protein  35.38 
 
 
393 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4135  hypothetical protein  35.1 
 
 
393 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.039492  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3837  hypothetical protein  35.1 
 
 
393 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0912  hypothetical protein  35.6 
 
 
377 aa  195  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000411962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2628  hypothetical protein  33.61 
 
 
393 aa  195  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146173  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2713  protein of unknown function DUF795  34.84 
 
 
383 aa  190  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000229662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1215  hypothetical protein  36.18 
 
 
377 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00118977  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1106  protein of unknown function DUF795  31.3 
 
 
417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.121777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4026  hypothetical protein  35.04 
 
 
377 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000427068  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1207  hypothetical protein  30.79 
 
 
379 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000131866  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1185  hypothetical protein  30.79 
 
 
379 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000205794  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1400  hypothetical protein  30.63 
 
 
385 aa  176  5e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325417  hitchhiker  2.53778e-23 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0716  hypothetical protein  30.05 
 
 
377 aa  166  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000484275  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1391  cytidyltransferase-related domain protein  32.18 
 
 
378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1579  hypothetical protein  32.39 
 
 
363 aa  157  4e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.224744  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1656  hypothetical protein  31.48 
 
 
369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.441829  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0236  hypothetical protein  33.61 
 
 
389 aa  150  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.370523  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf752  hypothetical protein  32.81 
 
 
298 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0951  hypothetical protein  35.14 
 
 
361 aa  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0716  hypothetical protein  34.83 
 
 
349 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.259332 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0107  hypothetical protein  31.46 
 
 
349 aa  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.421884  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1202  hypothetical protein  34.09 
 
 
349 aa  50.1  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.337201  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0781  hypothetical protein  37.31 
 
 
361 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>