12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0338 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0338  peptidase A24B  100 
 
 
230 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1052  preflagellin peptidase  94.78 
 
 
230 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1574  peptidase A24B, FlaK-like protein  92.61 
 
 
230 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.95055  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0184  peptidase A24B, FlaK-like protein  64.63 
 
 
234 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.932953  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0269  peptidase A24B, FlaK-like protein  59.83 
 
 
234 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.205091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1491  hypothetical protein  25.11 
 
 
254 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0687  peptidase A24A prepilin type IV  24.39 
 
 
260 aa  52.8  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.890474  normal  0.372888 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2136  peptidase A24A prepilin type IV  25.77 
 
 
330 aa  51.2  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0062  peptidase A24B, FlaK-like  24.28 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2005  peptidase A24A, prepilin type IV  21.65 
 
 
268 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.234873  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2921  hypothetical protein  26.1 
 
 
276 aa  44.3  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.360377 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0098  peptidase A24A prepilin type IV  21.64 
 
 
349 aa  42.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>