13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0297 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0297  ADP-specific phosphofructokinase  100 
 
 
462 aa  919    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.50546  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0606  ADP-specific phosphofructokinase  69.57 
 
 
465 aa  661    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.564145  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0541  ADP-specific phosphofructokinase  90.89 
 
 
463 aa  845    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0786902  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1378  ADP-specific phosphofructokinase  94.81 
 
 
462 aa  872    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0931276  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0005  ADP-specific phosphofructokinase  60.96 
 
 
475 aa  570  1e-161  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100171  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2004  ADP-specific phosphofructokinase  37.2 
 
 
489 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.297571  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1339  ADP-specific phosphofructokinase  35.42 
 
 
485 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.63071  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3826  ADP-specific phosphofructokinase  27.72 
 
 
467 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2005  ADP-dependent glucokinase  26.88 
 
 
478 aa  150  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00370881  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1338  ADP-dependent glucokinase  24.87 
 
 
384 aa  100  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1214  ADP-dependent glucokinase  23.53 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1525  ADP-specific phosphofructokinase/glucokinase  23.71 
 
 
417 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.74372  normal  0.678453 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02970  hypothetical protein  22.22 
 
 
393 aa  51.6  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>