12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2004 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2004  ADP-specific phosphofructokinase  100 
 
 
489 aa  1008    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.297571  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1339  ADP-specific phosphofructokinase  59.88 
 
 
485 aa  600  1e-170  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.63071  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0005  ADP-specific phosphofructokinase  38.16 
 
 
475 aa  317  4e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0297  ADP-specific phosphofructokinase  37.2 
 
 
462 aa  307  3e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.50546  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0541  ADP-specific phosphofructokinase  37.63 
 
 
463 aa  307  3e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0786902  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0606  ADP-specific phosphofructokinase  35.82 
 
 
465 aa  306  8.000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.564145  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1378  ADP-specific phosphofructokinase  36.99 
 
 
462 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0931276  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2005  ADP-dependent glucokinase  25 
 
 
478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00370881  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3826  ADP-specific phosphofructokinase  27.22 
 
 
467 aa  141  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1338  ADP-dependent glucokinase  22.55 
 
 
384 aa  93.2  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1525  ADP-specific phosphofructokinase/glucokinase  25.27 
 
 
417 aa  92  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.74372  normal  0.678453 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1214  ADP-dependent glucokinase  25.22 
 
 
406 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>