16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0611 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0611  PRC-barrel  100 
 
 
86 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.839052  normal  0.0202087 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0401  PRC-barrel domain-containing protein  52.44 
 
 
87 aa  93.6  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0625875  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2271  PRC-barrel domain-containing protein  52.33 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.15285 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0758  hypothetical protein  44.71 
 
 
90 aa  92  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.202719  normal  0.483124 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1640  PRC-barrel domain protein  41.67 
 
 
101 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3474  PRC-barrel domain protein  39.51 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.019348  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0876  PRC-barrel domain-containing protein  37.33 
 
 
88 aa  72.8  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.13914  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0150  PRC-barrel domain protein  46.34 
 
 
85 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.488973  normal  0.0263795 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0396  PRC-barrel domain protein  38.16 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1399  PRC-barrel domain protein  38.67 
 
 
100 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1747  hypothetical protein  31.76 
 
 
85 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.430138 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1465  PRC-barrel protein  32.1 
 
 
90 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.276426  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0090  PRC-barrel domain protein  38.46 
 
 
81 aa  62  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00611417  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2388  PRC-barrel domain protein  41.94 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0847  PRC-barrel domain-containing protein  26.14 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0723  PRC-barrel domain-containing protein  36.99 
 
 
82 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0603774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>