13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0090 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0090  PRC-barrel domain protein  100 
 
 
81 aa  157  4e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00611417  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1399  PRC-barrel domain protein  43.84 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1640  PRC-barrel domain protein  45.21 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0876  PRC-barrel domain-containing protein  36.99 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.13914  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3474  PRC-barrel domain protein  43.84 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.019348  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0611  PRC-barrel  38.46 
 
 
86 aa  62  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.839052  normal  0.0202087 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0758  hypothetical protein  36.14 
 
 
90 aa  61.2  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.202719  normal  0.483124 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0396  PRC-barrel domain protein  33.75 
 
 
103 aa  57.4  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1747  hypothetical protein  36.99 
 
 
85 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.430138 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1465  PRC-barrel protein  31.17 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.276426  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2388  PRC-barrel domain protein  37.1 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0401  PRC-barrel domain-containing protein  37.5 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0625875  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2271  PRC-barrel domain-containing protein  38.46 
 
 
105 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.15285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>