18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0076 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0076  hypothetical protein  100 
 
 
580 aa  1177    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0190792  normal  0.314766 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0860  hypothetical protein  50.78 
 
 
579 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.781635  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1087  hypothetical protein  50.99 
 
 
578 aa  597  1e-169  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113336  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1657  hypothetical protein  52.16 
 
 
578 aa  584  1.0000000000000001e-165  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0652307 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0934  FAD dependent oxidoreductase  41.45 
 
 
576 aa  422  1e-117  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0753636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0196  hypothetical protein  39.48 
 
 
583 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.814189  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2422  hypothetical protein  33.81 
 
 
618 aa  287  4e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.396799  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0030  hypothetical protein  30.31 
 
 
619 aa  265  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00669856  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1444  Protein of unknown function DUF2070, membrane  24.85 
 
 
566 aa  133  9e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0620  membrane protein-like protein  25.52 
 
 
581 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0544  membrane protein-like  25.39 
 
 
544 aa  95.1  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0450  membrane protein-like protein  24.88 
 
 
589 aa  80.1  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.336439  normal  0.520524 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0716  hypothetical protein  24.86 
 
 
536 aa  71.2  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.403776 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2078  hypothetical protein  25.23 
 
 
535 aa  71.2  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1950  hypothetical protein  25.19 
 
 
536 aa  69.3  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2307  hypothetical protein  25.43 
 
 
536 aa  60.5  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00335528 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0680  hypothetical protein  21.56 
 
 
533 aa  60.1  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000787674  hitchhiker  0.00000670884 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0167  Protein of unknown function DUF2070, membrane  20.19 
 
 
538 aa  57  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>