34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0376 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0376  protein of unknown function DUF92 transmembrane  100 
 
 
226 aa  427  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2803  hypothetical protein  69.57 
 
 
215 aa  218  7e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.238567 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0072  hypothetical protein  25.36 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.813723  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0532  hypothetical protein  31.7 
 
 
401 aa  66.2  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.461547 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1341  hypothetical protein  33.56 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0619  hypothetical protein  33.56 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.675202  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1722  hypothetical protein  29.36 
 
 
408 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1334  hypothetical protein  32.69 
 
 
237 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35069  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1343  hypothetical protein  31.32 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2065  protein of unknown function DUF92 transmembrane  30.56 
 
 
421 aa  60.1  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2624  hypothetical protein  33.03 
 
 
401 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1190  hypothetical protein  29.74 
 
 
257 aa  53.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.402529  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1287  hypothetical protein  36.97 
 
 
248 aa  51.6  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1927  protein of unknown function DUF92 transmembrane  30.86 
 
 
277 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000291197  hitchhiker  0.00000025153 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14261  hypothetical protein  30.9 
 
 
250 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0626  hypothetical protein  26.41 
 
 
470 aa  48.5  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135738  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2383  protein of unknown function DUF92 transmembrane  35.61 
 
 
259 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0669  hypothetical protein  25 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0343323  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1500  hypothetical protein  34.21 
 
 
391 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07261  hypothetical protein  23.45 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.124635  normal  0.0102759 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07221  hypothetical protein  23.28 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.341372  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0101  hypothetical protein  23.89 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0610  membrane protein  30.41 
 
 
526 aa  45.8  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3466  protein of unknown function DUF92 transmembrane  31.25 
 
 
248 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.871121  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0746  protein of unknown function DUF92 transmembrane  29.07 
 
 
521 aa  45.1  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.213381 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0257  hypothetical protein  32.79 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2637  protein of unknown function DUF92 transmembrane  31.11 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4898  protein of unknown function DUF92 transmembrane  24.88 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4686  protein of unknown function DUF92 transmembrane  28.71 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.347886  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0189  protein of unknown function DUF92 transmembrane  36.09 
 
 
257 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4223  hypothetical protein  29.66 
 
 
265 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.381218  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07421  hypothetical protein  23.12 
 
 
215 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07241  hypothetical protein  22.97 
 
 
220 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3310  integral membrane protein  26.87 
 
 
451 aa  42  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>