19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1206 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1206  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  174  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165418  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0922  hypothetical protein  73.33 
 
 
91 aa  137  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1454  hypothetical protein  63.86 
 
 
85 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1361  hypothetical protein  50 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000000331592  decreased coverage  0.00000000314529 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1416  hypothetical protein  49.44 
 
 
87 aa  95.1  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1058  hypothetical protein  48.78 
 
 
87 aa  94  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.762511  normal  0.258726 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1710  hypothetical protein  51.95 
 
 
87 aa  89.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0811  hypothetical protein  51.25 
 
 
87 aa  89.4  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.461956  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0199  hypothetical protein  45.12 
 
 
92 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.22014  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0402  hypothetical protein  46.84 
 
 
91 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.454599  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0435  hypothetical protein  46.84 
 
 
91 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175482  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1485  hypothetical protein  46.84 
 
 
91 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0504  hypothetical protein  50.62 
 
 
91 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1843  Protein of unknown function UPF0147  49.35 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0645  Protein of unknown function UPF0147  36.14 
 
 
90 aa  74.3  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2034  hypothetical protein  46.75 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0307  hypothetical protein  38.96 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.358002 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0932  hypothetical protein  42.53 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0463  hypothetical protein  45.78 
 
 
87 aa  69.3  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>