19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0645 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0645  Protein of unknown function UPF0147  100 
 
 
90 aa  182  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0435  hypothetical protein  51.19 
 
 
91 aa  85.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175482  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0402  hypothetical protein  51.19 
 
 
91 aa  85.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.454599  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1485  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  84.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1416  hypothetical protein  38.1 
 
 
87 aa  77.8  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1454  hypothetical protein  43.75 
 
 
85 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1206  hypothetical protein  36.14 
 
 
90 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165418  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0811  hypothetical protein  35.71 
 
 
87 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.461956  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0504  hypothetical protein  48.81 
 
 
91 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0199  hypothetical protein  42.17 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.22014  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1058  hypothetical protein  32.14 
 
 
87 aa  70.5  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.762511  normal  0.258726 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0922  hypothetical protein  33.73 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1361  hypothetical protein  30.95 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000000331592  decreased coverage  0.00000000314529 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1710  hypothetical protein  38.36 
 
 
87 aa  64.3  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1843  Protein of unknown function UPF0147  34.15 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2034  hypothetical protein  39.24 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0932  hypothetical protein  32.86 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0463  hypothetical protein  26.19 
 
 
87 aa  50.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0307  hypothetical protein  31.58 
 
 
89 aa  50.8  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.358002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>