32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0165 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0165  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  100 
 
 		 1035 aa  2112    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl098  oligopeptide ABC transporter periplasmic binding component  25.46 
 
 		 993 aa  219  2e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  27.97 
 
 		 537 aa  48.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  27.97 
 
 		 537 aa  48.5  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  27.97 
 
 		 537 aa  48.5  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  27.97 
 
 		 537 aa  48.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  27.97 
 
 		 537 aa  48.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1461  extracellular solute-binding protein  35.8 
 
 		 542 aa  47.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0157801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 541 aa  46.6  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 		 517 aa  46.2  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0546  4-phytase  22.08 
 
 		 552 aa  46.2  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0623  4-phytase  22.08 
 
 		 552 aa  46.2  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000146122  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0840  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  30.1 
 
 		 555 aa  45.4  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00138321  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  23.65 
 
 		 537 aa  45.4  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0220  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.5 
 
 		 546 aa  45.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3642  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.45 
 
 		 568 aa  45.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0215  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.5 
 
 		 546 aa  44.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0196  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.5 
 
 		 546 aa  44.7  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3377  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.45 
 
 		 568 aa  45.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0900205  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0183  solute-binding family 5 protein  25.5 
 
 		 546 aa  44.7  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0180  4-phytase  25.5 
 
 		 546 aa  44.7  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0186  solute-binding family 5 protein  25.5 
 
 		 546 aa  45.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0195  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.5 
 
 		 546 aa  44.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0237  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.5 
 
 		 546 aa  44.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  26.27 
 
 		 537 aa  44.7  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  26.27 
 
 		 537 aa  44.7  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  26.27 
 
 		 537 aa  44.7  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 537 aa  44.7  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  26.27 
 
 		 537 aa  44.7  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  26.27 
 
 		 537 aa  44.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0215  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  25.5 
 
 		 546 aa  44.7  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 		 537 aa  44.7  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>