47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1332 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1332  intracellular sulfur oxidation protein DsrF  100 
 
 		 122 aa  243  4.9999999999999997e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2188  sulfur relay protein TusC/DsrF  34.51 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.946925  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1954  DsrE family protein  37.07 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.414828  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2482  DsrF protein  29.57 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.067971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1656  DsrE family protein  34.48 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3994  sulfur relay protein TusC  37.17 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0906893  hitchhiker  0.00530974 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1951  DsrF protein  30.43 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0170075  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3599  sulfur relay protein TusC  37.17 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1839  sulfur relay protein TusC  37.17 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000201161 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1852  sulfur relay protein TusC/DsrF  29.41 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000304712  normal  0.0727441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0133  DsrE family protein  27.83 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000109278  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3398  sulfur relay protein TusC  37.93 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.451628 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0041  DsrF protein  28.7 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.630968  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2316  sulfur relay protein TusC/DsrF  27.83 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0137343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2378  sulfur relay protein TusC  31.9 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.643649  normal  0.0198653 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3442  intraceullular sulfur oxidation protein of DsrE family protein  32.98 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00176558  decreased coverage  0.0000258214 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0034  sulfur relay protein TusC/DsrF  28.18 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1924  DsrE-like protein  32.11 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.514773  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00059  sulfur oxidation protein dsrF  32.04 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3339  DsrF family protein  34.51 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324949  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002295  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusC  30.1 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000867918  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2602  sulfur relay protein TusC  35.92 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.707769  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3169  sulfur relay protein TusC  32.74 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.107229  normal  0.263841 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1780  hypothetical protein  32.04 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129474  normal  0.0463669 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0700  sulfur relay protein TusC/DsrF  29.57 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.137823  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30390  sulfur relay protein TusC  36.54 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3576  sulfur relay protein TusC  33.33 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1705  DsrE family protein  26.6 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195372  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2377  hypothetical protein  30.84 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2348  putative sulfur oxidation protein DsrF  24.53 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0587865  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2453  DsrE-like protein  30.39 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000033855  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1971  DsrE family protein  29.73 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000439065  normal  0.844283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2005  DsrE family protein  29.73 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0519969  hitchhiker  0.000302013 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2016  DsrE family protein  26.92 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000118416  hitchhiker  0.00293118 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28130  sulfur relay protein TusC  30.17 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2058  DsrE family protein  28.83 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0573181  hitchhiker  0.000337612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2164  DsrE family protein  28.57 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000849847  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2315  DsrE family protein  28.83 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000269455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4553  sulfur relay protein TusC  32.74 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1802  DsrE family protein  27.17 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.223353  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2207  DsrE family protein  28.97 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000232084  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2003  DsrE family protein  27.03 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000582885  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3680  sulfur relay protein TusC  28.45 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000021238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0273  sulfur relay protein TusC  28.45 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000969658  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3923  sulfur relay protein TusC  28.45 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000967034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2199  sulfur relay protein TusC/DsrF  30.61 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000409085  normal  0.0885071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2134  DsrE family protein  28.57 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.0152295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>