22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0888 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0888  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  317  3.9999999999999996e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.994726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3274  hypothetical protein  30.41 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3023  hypothetical protein  36.43 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1356  hypothetical protein  30.47 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3383  hypothetical protein  30.28 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20248  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1966  hypothetical protein  41.43 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.898664  normal  0.285375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1027  hypothetical protein  30.83 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.484746  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0059  hypothetical protein  39.44 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2556  hypothetical protein  31.9 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.876255  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1215  hypothetical protein  31.9 
 
 		 157 aa  43.9  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.105357  normal  0.0840729 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2337  hypothetical protein  25.58 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0865679 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0821  hypothetical protein  40.82 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4905  hypothetical protein  39.34 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102397  normal  0.115889 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1903  hypothetical protein  45.71 
 
 		 236 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0845396  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5036  hypothetical protein  27.78 
 
 		 146 aa  41.6  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0853  hypothetical protein  48.44 
 
 		 236 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1916  hypothetical protein  48.44 
 
 		 236 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0307  hypothetical protein  48.44 
 
 		 236 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.630758  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1645  hypothetical protein  48.44 
 
 		 236 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.682807  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1201  hypothetical protein  48.44 
 
 		 236 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2068  hypothetical protein  48.44 
 
 		 236 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0161763  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2438  hypothetical protein  44.44 
 
 		 221 aa  40.8  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.377514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>