32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_R0070 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_R0070  tRNA-His  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0007  tRNA-His  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831661  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0922  tRNA-His  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.543138  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1593  tRNA-His  89.33 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000819622  normal  0.473468 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0078  tRNA-His  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5730  tRNA-His  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5001  tRNA-His  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0535  tRNA-His  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07108e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4767  tRNA-His  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000106847  hitchhiker  8.57127e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0214  tRNA-His  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5817  tRNA-His  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000694475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5716  tRNA-His  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00269578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5032  tRNA-His  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0610  tRNA-His  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893119  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0137  tRNA-His  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000594746  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0084  tRNA-His  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624791  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1827  tRNA-His  86.67 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.148729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-His-2  tRNA-His  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000329782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-His-1  tRNA-His  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000556995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-2  tRNA-His  87.76 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000115828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-1  tRNA-His  87.76 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00869037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-2  tRNA-His  87.76 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0207429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-1  tRNA-His  87.76 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-2  tRNA-His  87.76 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000344538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-1  tRNA-His  87.76 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000104499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5681  tRNA-His  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00674866  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0176  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0032  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0080  tRNA-His  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0289577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0107  tRNA-His  86 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.576525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0048  tRNA-His  86 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0087  tRNA-His  86 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>