47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1835 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0476  hypothetical protein  99.04 
 
 
460 aa  642    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000243771  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0745  hypothetical protein  99.04 
 
 
460 aa  642    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1835  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  651    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1356  hypothetical protein  80.39 
 
 
402 aa  501  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1237  hypothetical protein  26.49 
 
 
444 aa  92.4  9e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.252969  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3360  protein of unknown function UPF0236  25.43 
 
 
455 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000531623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1615  protein of unknown function UPF0236  25.43 
 
 
455 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0133469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1419  protein of unknown function UPF0236  25.43 
 
 
455 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000631859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0500  protein of unknown function UPF0236  25.43 
 
 
455 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0921  hypothetical protein  23.78 
 
 
476 aa  66.2  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581224  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2232  hypothetical protein  23.78 
 
 
476 aa  66.2  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00123188  unclonable  0.00000000989665 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1481  protein of unknown function UPF0236  24.4 
 
 
455 aa  66.2  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1252  protein of unknown function UPF0236  24.4 
 
 
455 aa  66.2  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.578671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1055  protein of unknown function UPF0236  24.4 
 
 
455 aa  66.2  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000029842  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0249  protein of unknown function UPF0236  24.4 
 
 
455 aa  66.2  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3498  protein of unknown function UPF0236  23.53 
 
 
454 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2764  protein of unknown function UPF0236  23.13 
 
 
479 aa  62.8  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000474396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1683  protein of unknown function UPF0236  23.13 
 
 
479 aa  62.8  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0092  protein of unknown function UPF0236  23.13 
 
 
479 aa  62.8  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0188  protein of unknown function UPF0236  23.13 
 
 
479 aa  62.8  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0729  protein of unknown function UPF0236  23.13 
 
 
479 aa  62.8  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0892  protein of unknown function UPF0236  23.13 
 
 
479 aa  62.8  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1256  protein of unknown function UPF0236  23.13 
 
 
479 aa  62.8  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00350537  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1954  hypothetical protein  24.38 
 
 
471 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0069339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0770  hypothetical protein  24.38 
 
 
472 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0030  hypothetical protein  24.38 
 
 
472 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00177404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0622  hypothetical protein  24.38 
 
 
472 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0407627  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0780  hypothetical protein  24.38 
 
 
472 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0981  hypothetical protein  24.38 
 
 
472 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1109  hypothetical protein  24.38 
 
 
472 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00916427  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1527  hypothetical protein  24.38 
 
 
472 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1922  hypothetical protein  24.38 
 
 
472 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2239  hypothetical protein  24.38 
 
 
472 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.685977  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0817  hypothetical protein  25.83 
 
 
399 aa  48.5  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22880  hypothetical protein  22.97 
 
 
459 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12010  hypothetical protein  22.97 
 
 
459 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0722624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09850  hypothetical protein  22.97 
 
 
459 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09340  hypothetical protein  22.97 
 
 
459 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08860  hypothetical protein  22.97 
 
 
459 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000384305  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08430  hypothetical protein  22.97 
 
 
459 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07130  hypothetical protein  22.97 
 
 
459 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08590  hypothetical protein  20 
 
 
434 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08580  hypothetical protein  24.59 
 
 
459 aa  47  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1829  protein of unknown function UPF0236  24.34 
 
 
458 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000497336  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1931  protein of unknown function UPF0236  24.34 
 
 
455 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0481  protein of unknown function UPF0236  21.67 
 
 
467 aa  43.5  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.242971  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0875  protein of unknown function UPF0236  23.05 
 
 
455 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>