58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0476 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0476  hypothetical protein  100 
 
 
460 aa  954    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000243771  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0745  hypothetical protein  100 
 
 
460 aa  954    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1356  hypothetical protein  86.5 
 
 
402 aa  792    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1835  hypothetical protein  99.04 
 
 
314 aa  642    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1834  hypothetical protein  98.55 
 
 
138 aa  283  3.0000000000000004e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1237  hypothetical protein  28.08 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.252969  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2232  hypothetical protein  24.88 
 
 
476 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00123188  unclonable  0.00000000989665 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0921  hypothetical protein  25 
 
 
476 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581224  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3360  protein of unknown function UPF0236  24.58 
 
 
455 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000531623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1615  protein of unknown function UPF0236  24.58 
 
 
455 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0133469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1419  protein of unknown function UPF0236  24.58 
 
 
455 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000631859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0500  protein of unknown function UPF0236  24.58 
 
 
455 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1481  protein of unknown function UPF0236  23.94 
 
 
455 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1252  protein of unknown function UPF0236  23.94 
 
 
455 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.578671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1055  protein of unknown function UPF0236  23.94 
 
 
455 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000029842  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0249  protein of unknown function UPF0236  23.94 
 
 
455 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3498  protein of unknown function UPF0236  23.69 
 
 
454 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0780  hypothetical protein  23.32 
 
 
472 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2239  hypothetical protein  23.32 
 
 
472 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.685977  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0030  hypothetical protein  23.32 
 
 
472 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00177404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0622  hypothetical protein  23.32 
 
 
472 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0407627  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1109  hypothetical protein  23.32 
 
 
472 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00916427  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1527  hypothetical protein  23.32 
 
 
472 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1922  hypothetical protein  23.32 
 
 
472 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1954  hypothetical protein  23.83 
 
 
471 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0069339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0770  hypothetical protein  23.32 
 
 
472 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0981  hypothetical protein  23.32 
 
 
472 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2764  protein of unknown function UPF0236  23.82 
 
 
479 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000474396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0092  protein of unknown function UPF0236  23.82 
 
 
479 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0188  protein of unknown function UPF0236  23.82 
 
 
479 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0729  protein of unknown function UPF0236  23.82 
 
 
479 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0892  protein of unknown function UPF0236  23.82 
 
 
479 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1256  protein of unknown function UPF0236  23.82 
 
 
479 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00350537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1683  protein of unknown function UPF0236  23.82 
 
 
479 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08590  hypothetical protein  22.28 
 
 
434 aa  77.8  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07130  hypothetical protein  24.2 
 
 
459 aa  77.8  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08430  hypothetical protein  24.2 
 
 
459 aa  77.8  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12010  hypothetical protein  24.2 
 
 
459 aa  77.8  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0722624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09850  hypothetical protein  24.2 
 
 
459 aa  77.8  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22880  hypothetical protein  24.2 
 
 
459 aa  77.8  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08860  hypothetical protein  24.2 
 
 
459 aa  77.4  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000384305  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09340  hypothetical protein  24.2 
 
 
459 aa  77.8  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08580  hypothetical protein  24.34 
 
 
459 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0817  hypothetical protein  23.81 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0875  protein of unknown function UPF0236  24.01 
 
 
455 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1993  protein of unknown function UPF0236  22.17 
 
 
467 aa  60.8  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000779773  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1931  protein of unknown function UPF0236  24.27 
 
 
455 aa  60.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2444  protein of unknown function UPF0236  21.18 
 
 
462 aa  60.1  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2633  protein of unknown function UPF0236  21.18 
 
 
462 aa  60.1  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1829  protein of unknown function UPF0236  23.79 
 
 
458 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000497336  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1152  protein of unknown function UPF0236  21.18 
 
 
462 aa  60.1  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.471453 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0481  protein of unknown function UPF0236  21.43 
 
 
467 aa  60.1  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.242971  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0420  protein of unknown function UPF0236  22.75 
 
 
467 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000580166  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0046  protein of unknown function UPF0236  22.75 
 
 
467 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00191865  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0643  protein of unknown function UPF0236  21.92 
 
 
467 aa  58.2  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1163  protein of unknown function UPF0236  20.43 
 
 
467 aa  54.7  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00489953  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0363  protein of unknown function UPF0236  20 
 
 
467 aa  54.3  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00218859  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0511  protein of unknown function UPF0236  20.34 
 
 
467 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.935045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>