16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1834 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1834  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  284  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0476  hypothetical protein  98.55 
 
 
460 aa  283  4e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000243771  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0745  hypothetical protein  98.55 
 
 
460 aa  283  4e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1356  hypothetical protein  98.46 
 
 
402 aa  267  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1237  hypothetical protein  37.31 
 
 
444 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.252969  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2232  hypothetical protein  31.25 
 
 
476 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00123188  unclonable  0.00000000989665 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0921  hypothetical protein  33.33 
 
 
476 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581224  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08590  hypothetical protein  34.85 
 
 
434 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07130  hypothetical protein  33.85 
 
 
459 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08430  hypothetical protein  33.85 
 
 
459 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08860  hypothetical protein  33.85 
 
 
459 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000384305  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09340  hypothetical protein  33.85 
 
 
459 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09850  hypothetical protein  33.85 
 
 
459 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12010  hypothetical protein  33.85 
 
 
459 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0722624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22880  hypothetical protein  33.85 
 
 
459 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08580  hypothetical protein  33.85 
 
 
459 aa  40.8  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>