13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3617 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3617  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  361  5.0000000000000005e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000150148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2019  hypothetical protein  56.07 
 
 		 136 aa  98.6  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2376  hypothetical protein  52.34 
 
 		 144 aa  92.8  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2248  hypothetical protein  66.67 
 
 		 144 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.511858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2210  hypothetical protein  47.83 
 
 		 186 aa  86.3  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2624  hypothetical protein  58.57 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539354  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3561  hypothetical protein  54.93 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2253  hypothetical protein  55.71 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0366  hypothetical protein  50.7 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0154333 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1765  hypothetical protein  42.61 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2565  hypothetical protein  36.73 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2083  hypothetical protein  45.07 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.37201 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0349  hypothetical protein  43.48 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.734854  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>