9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3272 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3272  putative lipoprotein  100 
 
 		 232 aa  457  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000256043 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1198  lipoprotein  31.22 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1943  lipoprotein  32.5 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531626  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0656  putative lipoprotein  30.09 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0563  putative lipoprotein  31 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3792  lipoprotein  29.31 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1987  hypothetical protein  29.52 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1407  putative lipoprotein  25.55 
 
 		 236 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1342  putative lipoprotein  25.55 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>