16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3188 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3188  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  700    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00153473 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1253  esterase/lipase  57.06 
 
 		 354 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.406302  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4478  hypothetical protein  45.4 
 
 		 367 aa  298  7e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  hitchhiker  0.00262511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.04 
 
 		 1150 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1997  AB-hydrolase associated lipase region  32.28 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140936  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.34 
 
 		 1132 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  34.02 
 
 		 1152 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  33.05 
 
 		 1150 aa  155  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.95 
 
 		 1152 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05037  conserved hypothetical protein  23.49 
 
 		 1146 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0214915 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04684  triglyceride lipase-cholesterol esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08960)  25.77 
 
 		 465 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.33 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375375 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01798  ab-hydrolase associated lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14600)  26.98 
 
 		 638 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00192714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 357 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  26.56 
 
 		 357 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>