9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2236 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2236  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  248  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1781  hypothetical protein  41.18 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.502703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2416  phage protein  45.45 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0458536  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3249  hypothetical protein  44.16 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118695  hitchhiker  0.0000000000000536226 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3406  hypothetical protein  42.67 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.407617  unclonable  1.24414e-16 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2781  hypothetical protein  40.28 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1330  hypothetical protein  32.58 
 
 		 96 aa  43.5  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2690  hypothetical protein  35.82 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4085  hypothetical protein  32.56 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>