10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3406 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3406  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  197  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.407617  unclonable  1.24414e-16 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2781  hypothetical protein  64.2 
 
 		 82 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3249  hypothetical protein  43.3 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118695  hitchhiker  0.0000000000000536226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2416  phage protein  44.3 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0458536  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1781  hypothetical protein  37.76 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.502703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2236  hypothetical protein  42.67 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4085  hypothetical protein  34.78 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040255 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2690  hypothetical protein  36.9 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1179  hypothetical protein  35.37 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1627  hypothetical protein  41.46 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>