More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_t1799 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_t1799  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.53202e-16 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1805  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000574761 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0065  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0025  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.156326  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0065  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0054  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000878402  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0010  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0035  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0054  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.755946  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0016  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0041  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0636835  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0016  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000267693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0003  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.070805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0072  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.01367  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0009  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-6  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-7  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0082  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1783  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0022  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0003  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0410  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0182  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0553  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2178  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2450  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2493  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2571  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2608  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0020  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0080  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0169  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0052  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0032  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0119257  normal  0.670174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0013  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0119522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0044  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.541664  hitchhiker  0.000000158432 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1712  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2238  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 78 bp  97.6  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1510  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2157  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0033  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 78 bp  97.6  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.362537  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1705  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5641  tRNA-Ile  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5696  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5724  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000745652  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0103  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 78 bp  97.6  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00163997  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0153  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0196  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000704358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 79 bp  97.6  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000677485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 79 bp  97.6  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.511469  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000396068  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 79 bp  97.6  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000114514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 79 bp  97.6  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.265738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 79 bp  97.6  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-6  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000288872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 79 bp  97.6  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000494003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00200718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 79 bp  97.6  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000442244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0862  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 78 bp  97.6  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933142  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2188  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2257  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 78 bp  97.6  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.124846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0009  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 78 bp  97.6  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0348385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0003  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2321  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 78 bp  97.6  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2231  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0033  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1725  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.67576  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0010  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0003  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0026  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0540884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000936426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418225  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0053  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0102  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00179656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0131  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000907835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0135  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00338984  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1523  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0077  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.329264  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1274  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0003  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00193312  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0013  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000457589  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0057  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288839  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0077  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000402465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>