16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_t0178 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_t0178  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000622279 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0010  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0535352  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0013  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0563085  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0052  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201025  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0052  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000609044  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna6  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.349793  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0018  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000226987  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0028  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0007  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22668  hitchhiker  0.0000658151 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0049  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000660852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0018  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0351719  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0039  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395559  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0026  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3195t  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.215562  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0065  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337548 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>