22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2105 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2105  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  197  3.9999999999999996e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1816  protein of unknown function DUF464  38.24 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1191  hypothetical protein  36.54 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000235308  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1612  hypothetical protein  32.69 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000924259  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0437  hypothetical protein  29.9 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000258981  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1119  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  50.4  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000809722  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0529  protein of unknown function DUF464  30.84 
 
 
115 aa  50.1  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286178  normal  0.0909949 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0498  protein of unknown function DUF464  32.04 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2116  hypothetical protein  32.32 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0558  hypothetical protein  33.03 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1035  hypothetical protein  28.87 
 
 
103 aa  45.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0480432  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1181  hypothetical protein  32.84 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0182157  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0804  hypothetical protein  36.36 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2550  hypothetical protein  41.51 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000106725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2541  hypothetical protein  40.91 
 
 
110 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152963  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1210  hypothetical protein  29.41 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000386139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4337  protein of unknown function DUF464  52.63 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000147293  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0909  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0927  protein of unknown function DUF464  28.57 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000159239  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0413  hypothetical protein  28.43 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.10785  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1321  hypothetical protein  35.48 
 
 
110 aa  40.4  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108331  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0161  hypothetical protein  43.14 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000260837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>