36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0161 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0161  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  226  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000260837  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1321  hypothetical protein  49.09 
 
 
110 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108331  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2116  hypothetical protein  44.95 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2541  hypothetical protein  37.27 
 
 
110 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4523  hypothetical protein  34.55 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.240497 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4341  hypothetical protein  34.55 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279841  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4188  hypothetical protein  34.55 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000547321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4675  hypothetical protein  34.55 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000191649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4289  hypothetical protein  34.55 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000827033  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4177  hypothetical protein  34.55 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0909  hypothetical protein  35.51 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0558  hypothetical protein  40.95 
 
 
114 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4535  hypothetical protein  33.64 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000130616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4576  hypothetical protein  33.64 
 
 
114 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000139623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0673  hypothetical protein  33.64 
 
 
114 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056156  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3158  hypothetical protein  33.64 
 
 
114 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000286621  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1181  hypothetical protein  38.38 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0182157  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0529  protein of unknown function DUF464  36.7 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286178  normal  0.0909949 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4561  hypothetical protein  33.7 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00087171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4337  protein of unknown function DUF464  35.51 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000147293  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1612  hypothetical protein  35.87 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000924259  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1191  hypothetical protein  32.41 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000235308  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1369  hypothetical protein  29.36 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000330577  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1119  hypothetical protein  30.28 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000809722  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1816  protein of unknown function DUF464  30.34 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2652  protein of unknown function DUF464  33.64 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000115076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2550  hypothetical protein  42.31 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000106725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1210  hypothetical protein  27.62 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000386139  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0498  protein of unknown function DUF464  31.82 
 
 
111 aa  47.4  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0437  hypothetical protein  34.91 
 
 
103 aa  47  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000258981  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0204  hypothetical protein  31.46 
 
 
102 aa  47  0.00009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1736  hypothetical protein  26.67 
 
 
106 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1703  hypothetical protein  26.67 
 
 
106 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000260315  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl440  hypothetical protein  26.42 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425423  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0927  protein of unknown function DUF464  40 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000159239  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2105  hypothetical protein  43.14 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>