12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00530 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_00530  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  343  6e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16690  hypothetical protein  42.2 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1746  hypothetical protein  41.29 
 
 		 178 aa  92.8  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00373634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2269  hypothetical protein  38.99 
 
 		 181 aa  88.6  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000385921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6542  hypothetical protein  34.78 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.222472  normal  0.072913 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20110  hypothetical protein  32.5 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0332257  hitchhiker  0.00184991 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2132  hypothetical protein  36.13 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.985668  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3084  hypothetical protein  36.62 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  hitchhiker  0.00915514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6977  hypothetical protein  36.36 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4807  hypothetical protein  35.82 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0178  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.31931  normal  0.732129 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0403  hypothetical protein  26.92 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.41355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>