14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1469 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1469  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  667    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2405  Abortive infection protein  43.71 
 
 
632 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0998709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2735  hypothetical protein  36.75 
 
 
337 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394132  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1411  abortive infection protein  34.81 
 
 
367 aa  195  9e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0191  hypothetical protein  39.64 
 
 
334 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1937  hypothetical protein  36.07 
 
 
396 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1099  hypothetical protein  36.12 
 
 
368 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.203647  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2104  abortive infection protein  33.72 
 
 
373 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574556  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3325  hypothetical protein  32.95 
 
 
348 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2703  hypothetical protein  33.83 
 
 
356 aa  135  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3917  hypothetical protein  36.58 
 
 
404 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4507  oxidoreductase (related to aryl-alcohol dehydrogenase)-like protein  42.86 
 
 
431 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4106  hypothetical protein  31.08 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0886  hypothetical protein  24.26 
 
 
322 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>