12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3325 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3325  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  713    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1411  abortive infection protein  38.22 
 
 		 367 aa  227  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2735  hypothetical protein  34.1 
 
 		 337 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0191  hypothetical protein  35.82 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2405  Abortive infection protein  34.38 
 
 		 632 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0998709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2104  abortive infection protein  32.58 
 
 		 373 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574556  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1937  hypothetical protein  33.43 
 
 		 396 aa  163  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2703  hypothetical protein  31.99 
 
 		 356 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1099  hypothetical protein  32.1 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.203647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1469  hypothetical protein  32.87 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3917  hypothetical protein  31.48 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4507  oxidoreductase (related to aryl-alcohol dehydrogenase)-like protein  39.29 
 
 		 431 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.669557 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>