27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0151 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0151  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  686    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.549779  normal  0.66051 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2102  hypothetical protein  57.96 
 
 
378 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.030663  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3488  hypothetical protein  51.4 
 
 
366 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  0.120509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2350  hypothetical protein  53.77 
 
 
384 aa  256  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal  0.439683 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0500  hypothetical protein  43.98 
 
 
385 aa  210  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.380847 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1639  hypothetical protein  44.33 
 
 
382 aa  202  7e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1767  hypothetical protein  48.86 
 
 
371 aa  193  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.185384  decreased coverage  0.00269741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4754  hypothetical protein  43.08 
 
 
360 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2108  hypothetical protein  42.35 
 
 
377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.144075  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2576  hypothetical protein  38.59 
 
 
363 aa  155  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306519  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2285  hypothetical protein  36.92 
 
 
361 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3792  hypothetical protein  35.6 
 
 
382 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.824525  normal  0.342808 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1388  hypothetical protein  37.65 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324194  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3949  hypothetical protein  39.02 
 
 
355 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2805  putative lipoprotein  39.26 
 
 
377 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1696  hypothetical protein  39.26 
 
 
377 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2682  hypothetical protein  39.26 
 
 
377 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2906  hypothetical protein  39.26 
 
 
377 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.549778  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2381  hypothetical protein  39.26 
 
 
377 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1811  putative lipoprotein  36.9 
 
 
377 aa  124  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.213337  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1700  hypothetical protein  34.16 
 
 
434 aa  123  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.0852804 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2740  hypothetical protein  38.93 
 
 
377 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.066802  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6121  hypothetical protein  40.99 
 
 
381 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0698534  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1828  hypothetical protein  33.44 
 
 
366 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4726  hypothetical protein  32.54 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926949  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1487  hypothetical protein  36.84 
 
 
373 aa  60.1  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0540856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4253  hypothetical protein  62 
 
 
99 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.248133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>