16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2436 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2436  hypothetical protein  100 
 
 
516 aa  956    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1651  hypothetical protein  32.59 
 
 
624 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2684  hypothetical protein  27.98 
 
 
621 aa  64.7  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2515  hypothetical protein  24.68 
 
 
652 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0758792  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0051  hypothetical protein  35.75 
 
 
613 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.062012 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0333  hypothetical protein  27.71 
 
 
880 aa  57  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1794  hypothetical protein  26.92 
 
 
1245 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.69552  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2017  hypothetical protein  28.24 
 
 
880 aa  53.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000248245  normal  0.284056 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0223  hypothetical protein  28.49 
 
 
881 aa  50.1  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1942  hypothetical protein  25.21 
 
 
580 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0873468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1489  hypothetical protein  36.99 
 
 
623 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124741  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1010  hypothetical protein  22.27 
 
 
634 aa  49.3  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101857  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1629  hypothetical protein  23.68 
 
 
619 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2597  hypothetical protein  40.35 
 
 
619 aa  47.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2374  hypothetical protein  26.06 
 
 
881 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0423348  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1391  hypothetical protein  34.92 
 
 
619 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.86997 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>