33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3378 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3378  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  197  5e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2129  hypothetical protein  45 
 
 
99 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2203  hypothetical protein  47.06 
 
 
83 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382258  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4082  hypothetical protein  41.57 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0044  hypothetical protein  41.25 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3713  hypothetical protein  32.63 
 
 
118 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2025  hypothetical protein  37.93 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349188  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0863  hypothetical protein  42.17 
 
 
122 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0149  hypothetical protein  38.89 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2282  hypothetical protein  38.2 
 
 
103 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0718  hypothetical protein  39.76 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1034  hypothetical protein  39.02 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.205289  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1338  hypothetical protein  48.39 
 
 
108 aa  50.1  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4848  hypothetical protein  40.62 
 
 
97 aa  50.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.046747  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0533  hypothetical protein  36.59 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2826  hypothetical protein  29.35 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.841029  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3138  hypothetical protein  42.65 
 
 
287 aa  47  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4073  hypothetical protein  37.33 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4921  hypothetical protein  37.5 
 
 
278 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3152  hypothetical protein  52 
 
 
82 aa  45.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.34063  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4478  hypothetical protein  35.71 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.370909  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1085  hypothetical protein  49.28 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2147  hypothetical protein  41.46 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2130  hypothetical protein  39.68 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4576  hypothetical protein  31.87 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1796  hypothetical protein  41.1 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0161  hypothetical protein  38.46 
 
 
105 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4753  hypothetical protein  27.16 
 
 
232 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4895  hypothetical protein  32.56 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.904597  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1950  hypothetical protein  29.67 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0045  hypothetical protein  54.76 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4943  hypothetical protein  34.21 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.475224  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0935  hypothetical protein  38.71 
 
 
87 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553228  normal  0.4185 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>