13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_R0032 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_R0032  tRNA-His  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0836724  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0006  tRNA-His  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.119779  hitchhiker  0.0000201498 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0053  tRNA-His  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0045  tRNA-His  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0024  tRNA-His  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0036  tRNA-His  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0370477  normal  0.249392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0035  tRNA-His  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0024  tRNA-His  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.961461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0045  tRNA-His  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0046  tRNA-His  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0020  tRNA-His  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0047  tRNA-His  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2767  tRNA-His  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>