11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_R0007 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_R0007  tRNA-Pro  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182147  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0045  tRNA-Pro  97.62 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0067  tRNA-Pro  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0035  tRNA-Pro  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.928344  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0031  tRNA-Pro  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418817  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0036  tRNA-Pro  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0046  tRNA-Pro  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0243465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0057  tRNA-Pro  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0107433  normal  0.396712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0058  tRNA-Pro  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.387879  normal  0.0550835 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0044  tRNA-Pro  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.408268  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0028  tRNA-Pro  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>