22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2631 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2631  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  276  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.756366  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1257  hypothetical protein  26.14 
 
 
95 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000919836  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0587  hypothetical protein  32.88 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1592  MtN3 and saliva related transmembrane protein  29.87 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1915  hypothetical protein  27.16 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16431  hypothetical protein  32.89 
 
 
92 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.66402 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12511  hypothetical protein  34.57 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1553  hypothetical protein  26.44 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0006877 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2031  hypothetical protein  29.58 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.301765  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2305  MtN3 and saliva related transmembrane protein  31.34 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000162161  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0644  hypothetical protein  33.33 
 
 
90 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0618893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2686  hypothetical protein  27.38 
 
 
90 aa  43.9  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0894462  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3602  glutathione synthetase  29.58 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0101041 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0790  hypothetical protein  33.8 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0234458  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1244  hypothetical protein  27.27 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.454482 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06351  hypothetical protein  27.16 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.472103 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2465  MtN3 and saliva related transmembrane protein  29.58 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.25814  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0151  hypothetical protein  33.85 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891641  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1322  hypothetical protein  35.38 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf517  hypothetical protein  26.55 
 
 
242 aa  41.2  0.005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14181  hypothetical protein  30.34 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923582 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1876  MtN3 and saliva related transmembrane protein  37.25 
 
 
106 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.200179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>