49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1553 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1553  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  192  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0006877 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2686  hypothetical protein  97.75 
 
 		 90 aa  179  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0894462  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2031  hypothetical protein  64.71 
 
 		 92 aa  118  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.301765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1257  hypothetical protein  54.02 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000919836  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0644  hypothetical protein  54.88 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0618893  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1370  hypothetical protein  55.29 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171684  hitchhiker  0.0000272645 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1476  hypothetical protein  47.95 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1915  hypothetical protein  43.53 
 
 		 98 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16431  hypothetical protein  35.29 
 
 		 92 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.66402 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0949  hypothetical protein  39.77 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.108318 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0790  hypothetical protein  34.12 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0234458  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0192  hypothetical protein  37.35 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6970  hypothetical protein  38.96 
 
 		 83 aa  67.8  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0587  hypothetical protein  37.35 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0862  hypothetical protein  50.77 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.615503  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12051  hypothetical protein  34.88 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.822613 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06351  hypothetical protein  35.37 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.472103 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2290  hypothetical protein  43.37 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2465  MtN3 and saliva related transmembrane protein  41.56 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.25814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4699  hypothetical protein  36.14 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3696  hypothetical protein  32.56 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1592  MtN3 and saliva related transmembrane protein  31.03 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2305  MtN3 and saliva related transmembrane protein  42.86 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000162161  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0517  hypothetical protein  39.24 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.771675  normal  0.68249 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2883  hypothetical protein  36.78 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13661  hypothetical protein  43.55 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0179157  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1419  Cystinosin/ERS1p repeat  34.83 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14181  hypothetical protein  32.22 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923582 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0151  hypothetical protein  44.87 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891641  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1274  hypothetical protein  38.71 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2007  MtN3 and saliva related transmembrane protein  34.41 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13451  hypothetical protein  33.75 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.159936  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2356  hypothetical protein  32.14 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00220  hypothetical protein  37.18 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1322  hypothetical protein  33.72 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2119  hypothetical protein  34.62 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000309813  normal  0.401636 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1244  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.454482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3357  MtN3 and saliva related transmembrane protein  32.56 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4623  hypothetical protein  36.9 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12511  hypothetical protein  33.72 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3602  glutathione synthetase  30.95 
 
 		 94 aa  50.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0101041 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0194  hypothetical protein  31.51 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.887922  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1876  MtN3 and saliva related transmembrane protein  35.94 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.200179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3622  MtN3 and saliva related transmembrane protein  31.58 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0171455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2631  hypothetical protein  26.44 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.756366  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4557  hypothetical protein  25.58 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1930  hypothetical protein  27.85 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.787441  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2565  hypothetical protein  32.14 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2419  hypothetical protein  32.14 
 
 		 88 aa  40  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>