14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0959 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0959  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  431  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000203172  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2105  hypothetical protein  45.93 
 
 
206 aa  194  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2113  hypothetical protein  45.67 
 
 
206 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2384  hypothetical protein  23.96 
 
 
209 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3444  hypothetical protein  27.64 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0700  hypothetical protein  30.37 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3067  hypothetical protein  27.09 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0651  hypothetical protein  23.22 
 
 
211 aa  63.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  34.69 
 
 
187 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  31.31 
 
 
181 aa  51.6  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  33.67 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  30.65 
 
 
185 aa  45.1  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3548  hypothetical protein  19.81 
 
 
205 aa  42  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  26.4 
 
 
189 aa  41.6  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>