14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1951 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1951  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000336619  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1824  hypothetical protein  75.41 
 
 
61 aa  101  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0027119  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2085  hypothetical protein  55 
 
 
60 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.62611e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2132  hypothetical protein  54.24 
 
 
60 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000336864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1289  hypothetical protein  45.16 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0951053  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3229  hypothetical protein  50.85 
 
 
91 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1032  hypothetical protein  50.85 
 
 
91 aa  60.1  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2504  hypothetical protein  47.92 
 
 
55 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.037492  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1074  hypothetical protein  46.3 
 
 
62 aa  50.4  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2511  hypothetical protein  44.9 
 
 
56 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0047  hypothetical protein  36.67 
 
 
64 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000731108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0048  hypothetical protein  33.33 
 
 
64 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0051  hypothetical protein  32.2 
 
 
59 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0050  hypothetical protein  33.9 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>