13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0048 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0048  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0047  hypothetical protein  91.94 
 
 		 64 aa  120  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000731108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0051  hypothetical protein  38.98 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0050  hypothetical protein  38.98 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1032  hypothetical protein  42 
 
 		 91 aa  52  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3229  hypothetical protein  38.71 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1289  hypothetical protein  38.98 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0951053  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2132  hypothetical protein  37.5 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000336864  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2085  hypothetical protein  38.89 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.62611e-25 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2504  hypothetical protein  40.82 
 
 		 55 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.037492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1951  hypothetical protein  33.33 
 
 		 62 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000336619  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1824  hypothetical protein  33.93 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0027119  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2511  hypothetical protein  44.44 
 
 		 56 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>