11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1546 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1546  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  315  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.494951  normal  0.416793 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2163  hypothetical protein  78.26 
 
 		 160 aa  254  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0090  hypothetical protein  78.12 
 
 		 158 aa  245  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2059  hypothetical protein  75 
 
 		 153 aa  228  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000987265 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3652  hypothetical protein  73.75 
 
 		 155 aa  218  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1333  hypothetical protein  73.53 
 
 		 157 aa  200  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3675  hypothetical protein  62.5 
 
 		 150 aa  179  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.360265  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3080  hypothetical protein  68.97 
 
 		 156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.650547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2925  hypothetical protein  55.24 
 
 		 154 aa  164  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.778441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1713  hypothetical protein  42.31 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00421873  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1641  hypothetical protein  29.37 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0514725  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>