11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2163 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2163  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  323  6e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2059  hypothetical protein  83.23 
 
 		 153 aa  262  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000987265 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1546  hypothetical protein  78.26 
 
 		 160 aa  254  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.494951  normal  0.416793 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0090  hypothetical protein  71.7 
 
 		 158 aa  231  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3652  hypothetical protein  75 
 
 		 155 aa  227  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1333  hypothetical protein  72.34 
 
 		 157 aa  206  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3675  hypothetical protein  61.01 
 
 		 150 aa  187  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.360265  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2925  hypothetical protein  54.37 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.778441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3080  hypothetical protein  65.22 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.650547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1713  hypothetical protein  37.89 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00421873  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1641  hypothetical protein  27.5 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0514725  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>