25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1905 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1905  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  677    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4773  hemin-degrading family protein  27.24 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0444544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5316  hemin-degrading family protein  27.05 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4837  hemin-degrading family protein  27.4 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5430  hemin-degrading  27.4 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.555546  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5432  hemin-degrading family protein  27.4 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0323497  normal  0.82601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0220  heme degradation protein  26.96 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3337  hemin-degrading family protein  23.71 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384676  hitchhiker  0.00153291 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2140  hemin transport protein HmuS  25.81 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.770349  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1780  hemin transport protein HmuS  25 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2090  hemin transport protein HmuS  25 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0439  hemin transport protein HmuS  25 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1116  hemin transport protein HmuS  25 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.95887  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0825  hemin transport protein HmuS  25 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.986285  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1827  hemin transport protein HmuS  25 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.570076  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0346  hemin transport protein HmuS  25 
 
 		 383 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2168  hemin-degrading family protein  21.74 
 
 		 344 aa  49.7  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.41951  normal  0.140472 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1604  hemin-degrading  21.16 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.837253  unclonable  0.000000365455 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0183  hemin-degrading family protein  21.28 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0870539 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3621  hemin-degrading family protein  22.3 
 
 		 358 aa  47  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2133  hemin-degrading  24.83 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.632586  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2036  Hemin-degrading family protein  24.29 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3802  hemin transport protein HmuS  20.59 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.157449  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0649  hemin transport protein  20.5 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.626507 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3890  hemin-degrading family protein  20.5 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>